氣相色譜儀氣源是一個載氣接連運轉、管路密閉的體系。氣路體系的氣密性，載氣流速的穩定性，以及流量丈量的準確性都對色譜試驗成果有影響，需求注意操控。氣相色譜中常用的載氣有：氫氣、氮氣、氦氣、氬氣和空氣。這些氣體除空氣可由空壓機供應外，一般都由高壓鋼瓶供應。一般都要經過凈化、穩壓和操控、丈量流量。
　　氣相色譜儀氣源該如何做準備與凈化工作呢？
　　1.氣相色譜儀氣源準備事先準備好需用氣體的高壓鋼瓶，某一種氣體的鋼瓶只能裝這種氣體，每個鋼瓶的顏色代表一種氣體，不能互換。一般用氮氣，氫氣，空氣這三種氣體，每種氣體準備兩個鋼瓶，以備用。有的使用氫氣發生器和空氣壓縮機，但空壓機必須無油。凡鋼瓶氣壓下降到1~2Mpa時，應更換氣瓶。一般使用使用以上氣體99.99%即可，電子捕獲檢測器必須使用高純氣源99.999%以上。
　　2.氣相色譜儀氣源凈化為了出去各種氣體中可能含有的水分、灰分和有機氣體成分，在氣體進入氣相色譜儀之前應先經過嚴格凈化處理。若全部使用鋼瓶氣體，有的氣相色譜儀附有凈化器，且內已填有分子篩，活性炭，硅膠，基本可滿足要求。若使用一般氫氣發生器，則必須加強對水分的凈化處理，故應增大干燥管面積,并在氣相色譜儀發生器后接容積較大的儲器桶，以減少或克服氣源壓力波動時對儀器基線的影響。若使用空壓機作空氣來源，空壓機進氣口應加強空氣過濾，加大凈化管體積，在干燥管內應填充一半分子篩，一半活性炭。一般國產無油氣體壓縮機可滿足需要。
　　只有了解好氣相色譜儀氣源的準備與凈化，才可以減少實際應用時發生的錯誤。